Las aspiraciones de la creación de la UNFAY se remontan a los primeros años del siglo XXI, cuando diversos sectores de la sociedad impulsaron iniciativas legislativas orientadas a establecer una institución universitaria que atendiera las necesidades educativas de la población aymara.
Desde el 2007 se promovieron proyectos legislativos para la creación de una universidad en Yunguyo, los cuales fueron fortalecidos posteriormente mediante propuestas orientadas a consolidar una universidad con identidad intercultural y vocación de integración fronteriza. A lo largo de los años, diversas autoridades nacionales, regionales y locales, así como organizaciones de la sociedad civil, contribuyeron a mantener vigente esta causa, convencidos de que la educación constituye el principal instrumento para transformar realidades y construir oportunidades.
Es así que el hito trascendental en la historia educativa de la región Puno ocurrió el 4 de julio de 2024, cuando tras un amplio proceso de debate y consenso político, el Congreso de la República aprobó la creación de la UNFAY, mediante la promulgación de la Ley N° 32090, reconociendo de esta forma la necesidad de ampliar la cobertura de educación superior universitaria en una de las zonas más importantes de la frontera peruana.
La creación de la UNFAY no constituye únicamente la fundación de una nueva institución de educación superior; representa la cristalización de un anhelo histórico largamente esperado por autoridades, organizaciones sociales y población en general.
La primera Comisión Organizadora de la universidad fue conformada mediante la RVM N° 115-2024-MINEDU, órgano encargado de conducir el proceso de implementación institucional, recibiendo su primer presupuesto en noviembre de 2025, desde entonces se viene impulsando importantes acciones orientadas al Licenciamiento.
Creada con Ley N° 32090
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